
近日,广州医科读书首要附设医院口腔科王学浩院士评选的团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,核蛋白互作组和靶向治疗电量代谢转化检测分析服务。
因为名称:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
英文版版头:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
的客户机关单位:南京医科大学
设计材料:细胞
拜谱打造服务于:转录组测序+核蛋白互作组+靶向疗法能力基础代谢组
方法自驾路线:
研究探讨結果
01、YBX1被鉴别为HCC中糖酵解的关键的DNA
本概述一下提取HCC癌肿样表(n=7)的单安排结构RNA测序信息报告集实行概述一下,会发现糖酵解抗逆性主耍密集在癌肿安排结构中,hdWGCNA概述一下快速精确出9个遗传基因控制模块(图1A-G)。TCGA-LIHC列队的经营模式概述一下确保YBX1为自主经营模式隐患影响(图1H)。进1步融入IHC、WB实验报告和癌肿安排结构与附近非癌肿安排结构的房间转录组学信息报告集核实YBX1是肝安排结构癌开展的不确定性靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被明确为调低HCC细胞系糖酵解的的关键客观因素
02、YBX1有助于HCC中的有氧糖酵解和繁衍
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向药物能量转换代谢转化组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1促进会HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
03、OGT与YBX1相结合并加快YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,球蛋白互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1结合起来并有利于YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化利于其磷过酸,导致利于其核转位
进这这一步检查YBX1的O-GlcNAc糖基化是不是作用其磷酸性反应,在OGT敲低的HCC神经生殖细胞中或用OGT减弱剂OSMI-1治理,YBX1蛋清程度重要拉低,YBX1磷酸性反应重要可以减少(图4A-C)。IP进行实验界面显示,在一致的Flag-YBX1底物程度下,YBX1-WT的磷酸性反应程度重要高与YBX1-T57A,意味着磷酸性反应的提高实际上仅是为了更快的YBX1蛋清表述(图4D)。提取了核和质类物质找到TMG治理的HCC神经生殖细胞中YBX1核表述的身高(图4E-F),进这这一步找到YBX1磷酸性反应的关键性缓解系数是AKT(图4G-I)。他们找到特别指出O-GlcNAc糖基化确认增进其磷酸性反应来激发YBX1蛋清安稳性并增进核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 绘制有立于于其进十步进行磷碱化绘制并够利于其核转位
05、YBX1加速PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1利于PKM2转录
06、YBX1 能的提升组蛋白质乳碱化呈现级别
研究分析察觉YBX1敲低为正相关降底血清质乳硝凝成用,尤为是H3K18乳硝凝成用(图6A-C)。糖酵解治理和改善剂2-DG的实验室断定了糖酵解与组血清乳硝凝成用的马上的连接,治理和改善糖酵解可为正相关降底H3K18la情况(图6D)。PKM2过展示可逆性转YBX1敲低造成的的H3K18la下跌,之外源乳酸加工处理除了的提升H3K18la,还随YBX1展示上浮,显示系统产生单向评议(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR断定,H3K18la按照含有于YBX1打火子马上的有利于其转录,该工作受O-GlcNAc糖基化干预(图6H-J),并察觉P300 上浮是YBX1增进H3K18乳酰凝成用的系统(图6K-L)。
图6.YBX1加强H3K18乳碱化掩盖总体水平
内容总结ppt
在这个探究中媒体报道了YBX1在HCC中高表述,与此同时与糖酵破解切对应。YBX1在T57处被O-GlcNAc突显,最后提升氨基酸质并延长其表述。各种突显还利于YBX1在T57处的磷硝化作用,利于其核易位。所以说,这些工作提升了糖酵解对应DNA的转录并刺激性乳酸的发生。凡此种种,YBX1系统激活P300的转录,因而驱动安装组氨基酸的乳硝化作用,尤其是H3K18la,H3K18乳硝化作用正方向国家宏观调控YBX1DNA转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观基因遗传正反面馈环系统图
拜谱总结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物技术为该研究提供了转录组测序,球蛋白互作组和靶向药物势能排泄组技术服务,拜谱生物体建立了完善成熟的转录组学、核蛋白组学、译为后遮盖组学、细胞代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
参考选取文章
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.